実践

実践

技術レポート再現(フィンガープリントによる化合物の予測根拠可視化 | 三井化学)

これまでの記事では、Fingerprintの可視化や構造式描画のカスタマイズについてまとめてきた。 今回は、それらでまとめてきた手法を駆使して、機会学習による化合物の物性予測根拠の可視化を実施する。 具体的には、第43回ケモインフォマティク...
実践

MI関連技術レポート再現(AIを用いたポリマー設計・検証サイクルの試行回数大幅低減 | 昭和電工)

マテリアルズインフォマティクス に関する企業の技術レポート・解析内容を再現する。 はじめに 技術レポート内容 以下は、産総研の研究成果記事(2018/11/27)1より 昭和電工株式会社(社長:森川 宏平 以下、昭和電工)と国立研究開発法人...
実践

化合物の溶解度予測(予測の信頼性も評価する)

化合物の溶解度予測(基礎編)をベースにして、今回は予測の信頼性(=予測値の分散=予測値がどれだけ不安定か)も合わせて評価した。 具体的には、分割の異なる訓練・テストデータを使って何度も予測を行うことで、予測値がどれだけブレるか検証した。 目...
実践

化合物の溶解度予測(基本編)

オープンになっているデータセット、具体的には1290化合物の水溶解度のデータで構造物性相関解析(いわゆるQSPR)を行う。 目的 分子の水溶解度(LogS)を予測すること 諸条件 データ 1290分子の水溶解度(LogS)データ(sdfファ...