データ

CIRpyを活用した化合物情報の取得

CIRpyについてアメリカ国立衛生研究所(NIH)が提供している化学情報検索サービスChemical Identifer Resolver (CIR)を利用すると、化合物の情報（SMILESやIUPAC名など）を検索キーワードとして、その...

ケモインフォマティクスデータ

スクレイピングで化合物データを試薬サイトから収集する

はじめにマテリアルズインフォマティクス、材料分野におけるデータ解析では、データがないという問題に直面することが多々ある。試薬サイトには化合物の基礎物性情報が集約されているため、そこからデータを収集してみた。（試薬サイトのサイト名、サイトU...

pubchem から化合物情報を一気に取得する

目的化合物の基本的な情報（化合物名やCASなど）から、その化合物の情報（カノニカルSMILESや、分子量などの基本的な記述子）を取得する。（SMILES情報があれば記述子を計算→化合物の物性予測の変数として使用できるが、SMILESを収...

外部データベースのまとめ（ケモインフォマティクス）

主にケモインフォマティクスで活用できそうな外部データベースのまとめ。 API利用などで一括取得が可能なDB Pubchem 化合物のデータベース。(APIを使った自動取得が可能） (参考：pubchem から化合物情報を一気に取得...