可視化

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pythonを使った三角ダイアグラム(ternary plot)の描画

三角プロット(ternary diagram)とは 三角プロット(ternary diagram)は,3成分のデータを三角形のグラフにプロットしたもので、3成分の相対的な割合(組成データなど)をによって,正三角形の位置でグラフ化する。プロッ...
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bokeh入門(インタラクティブなグラフ作成)

bokeh とは インタラクティブなデータ可視化ライブラリ (参考:bokehを使ったデータ可視化例) (作成したグラフの例) bokehのチュートリアル(First steps)のうち、必要そうな部分をまとめた。 Step 1-3. グラ...
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変数のクラスタリングとデンドログラム作成

回帰分析やクラス分類をする際、ある2つの説明変数間に強い相関がある(=相関係数の絶対値が大きい)とき、それらの変数のうちどちらか1つの変数を削除する必要がある。単に、説明変数の数を減らすだけならこの方法で問題ないが、モデルに解釈な必要な変数...
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主成分分析の概要とpython実装

主成分分析について 概要 教師なし手法の一つであり、PCA(Principal Component Analysis)と呼ばれる。 多次元のデータを低次元化する手法であり、データの可視化によく用いられる。 (低次元化し2次元にマッピングす...
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相関係数の計算と可視化

データ解析・ケモインフォマティクスでは、ある化合物の物性など(目的変数)に対して、実験条件や記述子など(説明変数)が関係しているか調査するために、相関係数を計算することが必須の作業になる。 本記事では相関係数の種類や計算方法についてまとめた...