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スクレイピングで化合物データを試薬サイトから収集する

はじめに マテリアルズインフォマティクス、材料分野におけるデータ解析では、データがないという問題に直面することが多々ある。試薬サイトには化合物の基礎物性情報が集約されているため、そこからデータを収集してみた。(試薬サイトのサイト名、サイトU...
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pubchem から化合物情報を一気に取得する

目的 化合物の基本的な情報(化合物名やCASなど)から、その化合物の情報(カノニカルSMILESや、分子量などの基本的な記述子)を取得する。 (SMILES情報があれば記述子を計算→化合物の物性予測の変数として使用できるが、SMILESを収...
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外部データベースのまとめ(ケモインフォマティクス )

主にケモインフォマティクスで活用できそうな外部データベースのまとめ。 API利用などで一括取得が可能なDB Pubchem 化合物のデータベース。(APIを使った自動取得が可能) (参考:pubchem から化合物情報を一気に取得...